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微波干燥设备是无线电波中频率较高的频段，在300兆赫到300千兆赫（波长为1m-1mm）。当微波辐射到物体上时，未被反射的电磁波进入到物体内部与构成物体的分子等物质发生相互作用，对于不同的物质，微波能产生热效应、生物效应和化学效应等能量转换，从而产生热量达到加热的目的。
微波干燥设备杀菌原理：
微波干燥设备杀菌是利用了电磁场的热效应和生物效应共同作用的结果。物料中的虫卵和细胞也会因分子极化驰豫，同时吸收微波升温，微波对细胞的热效应使蛋白质变性而死亡；微波对细胞的生物效应是微波电场改变细胞膜断面的电位分布，影响细胞膜周围电子和离子浓度，从而改变 细胞膜的通透性能，细胞因此营养不良，不能正常新陈代谢，细胞结构功能紊乱，生长发育受到抑制而死亡。此外，决定细胞正常生长和稳定遗传繁殖的核酸（RNA）和脱氧核糖核酸（DNA）是由若干氢键紧密连接而成的卷曲型大分子，足够强的微波可以导致氢键松弛、断裂和重组，从而诱发遗传基因突变或染色体畸变。微波干燥设备的生物效应在杀菌中起到了常规物理杀菌所没有的特殊作用。
微波干燥设备加热主要特点:
1、加热快速
微波干燥设备它是使被加热物体本身成为发热体，不需要热传导过程。因此，尽管是热传导性较差的物料，也可以在极短的时间内达到加热温度。
2、均匀加热
无论物体各部位形状，微波干燥设备加热均可使物体表里同时均匀渗透电磁波而产生热能。所以物体内外加热均匀性基本一致。
3、节能
在微波干燥设备加热过程中除了被加热物料升温外，几乎无其它损耗。故热效率高、节能。
4、防酶、杀菌、保鲜
微波干燥设备加热具有热效应和生物效应，能在较低温度下杀菌和防酶保鲜。由于加热速度快、时间短，能较大限度地保存物料的活性和原有物料的色泽和营养成分。
5工艺先进可实现自动化控制
只要控制微波干燥设备功率即可实现立即加热
